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液-液相分离(LLPS)研究新高,AG百家乐助力生信预测+分子机制+药物干预,抓住机会!

来源:邓泽毅 日期:2025-07-26

7月尚未结束,令人振奋的消息不断传来!液-液相分离(Liquid–liquid phase separation,LLPS)作为细胞区室化的新兴调控机制,通过动态形成生物分子凝聚体,在生物体内参与转录调控、信号传导、应激响应、表观遗传重塑等多重生理活动。自7月17日起,仅本月就已发表49篇与LLPS相关的研究论文,其中一区文章占80%,研究结果令人鼓舞!在科研道路上,方向选择至关重要。近年来,液-液相分离(LLPS)已成为生物医学领域的热点,尤其在癌症生物学中,其多维调控机制及治疗潜力得到广泛关注,还延展至神经退行性疾病(如ALS)、自身免疫病、心血管疾病等多个领域,展现出多个研究方向的可能性。

液-液相分离(LLPS)研究新高,AG百家乐助力生信预测+分子机制+药物干预,抓住机会!

1. 液-液相分离+靶向药物疗法
2. 液-液相分离+肿瘤微环境调控
3. 液-液相分离+疾病转录调控

研究步骤包括:1. 筛选目标分子/蛋白;2. 在线工具IUPred2/PONDR预测关键蛋白具备液-液相分离(LLPS);3. 中断相分离以探讨转录调控机制;4. 体内/外LLPS观测;5. 化合物筛选发现抑制剂;6. 药物干预的体内外功能验证。

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近期一篇获得128分的研究论文通过综合的多组学与实验验证明确了WDR3在骨肉瘤中的液-液相分离关键作用,为LLPS驱动的肿瘤治疗提供了重要依据。2025年7月11日,中国医科大学研究团队在《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》上发表了题为《WDR3 undergoes phase separation to mediate the therapeutic mechanism of Nilotinib against osteosarcoma》的论文。这项研究利用生物信息学方法,筛选出对骨肉瘤预后具有价值的LLPS相关生物标志物,并探讨其与免疫景观及药物敏感性的关联。

研究的具体内容包括:1. 生物信息学筛选
- 数据来源:整合GEO和TARGET数据库的骨肉瘤患者转录组数据(124例),结合正常样本进行比较,筛选出与LLPS相关的差异表达基因(DEGs)交集(473个基因)。
- 预后模型:通过Cox回归和LASSO分析,确定5个关键基因(ANXA10、MYC、TIMM8A、WASF3、WDR3),构建风险评分模型并验证其预测效能(AUC07)。
2. 分子机制验证
- WDR3的功能:通过qPCR/WB验证WDR3在骨肉瘤细胞(U2-OS、HOS、MG-63)中的高表达;敲低WDR3可抑制细胞增殖、迁移和侵袭(体外),并减小小鼠移植瘤体积(体内)。
- LLPS特性:重组WDR3蛋白在低盐和高浓度下形成液滴,荧光恢复实验(FRAP)证实其液态行为,IDR突变则破坏液滴的形成。

3. 药物机制
- 分子对接:WDR3与尼洛替尼结合能最低(-93kcal/mol),形成稳定的复合物。
- 治疗效应:尼洛替尼处理可抑制WDR3的mRNA和蛋白表达,减少LLPS凝聚体的形成,抑制骨肉瘤的进展(体外和体内)。

综上所述,生物信息学分析筛选出5个对骨肉瘤预后具有预测价值的LLPS相关生物标志物,表明这些基因与免疫细胞浸润、肿瘤免疫逃逸及药物敏感性显著相关。WDR3作为骨肉瘤预后风险因子,与尼洛替尼在分子对接模型中形成稳定结合,显著抑制骨肉瘤的恶性进展。更重要的是,WDR3能在U2-OS细胞内形成液滴结构,其凝聚体在荧光漂白后表现出典型的液态行为特征。IDR突变会损害WDR3的相分离能力,而融合hnRNPA1的IDR可挽救这一能力。此外,尼洛替尼治疗在体内外均能改善骨肉瘤进展,同时抑制WDR3的相分离凝聚体形成。

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